|
|
Zvýšení rozlišení perfúzního zobrazování magnetickou rezonancí pomocí komprimovaného snímání
Mangová, Marie ; Polec,, Jaroslav (oponent) ; Šmídl, Václav (oponent) ; Rajmic, Pavel (vedoucí práce)
Perfúzní zobrazování v magnetické rezonanci je lékařská diagnostická metoda, která vyžaduje vysoké prostorové i časové rozlišení. Toto vysoké rozlišení je důležité proto, aby bylo možné zachytit dynamiku nitrožilně podané kontrastní látky, která se pro měření perfúze používá. Magnetická rezonance má však svá fyzikální omezení, která nedovolují dosáhnutí současně vysokého časového i prostorového rozlišení. Práce se zabývá komprimovaným snímáním, které umožňuje rekonstrukci obrazu i z relativně malého počtu naměřených dat (pod Nyquistovým kritériem), zatímco rozlišení potřebné k perfúzní analýze se zvýší. Toho lze dosáhnout pomocí vhodně navržených apriorních informací o snímaných datech a sestavení modelu. Rekonstrukce pak probíhá jako optimalizační problém. Dizertační práce přináší několik nových rekonstrukčních modelů, dále navrhuje metodu, jak zmenšit vychýlenost těchto odhadů, a zkoumá vliv komprimovaného snímání na perfúzní parametry. Celá práce je zakončena rozšířením komprimovaného snímání na trojrozměrná data, u kterých je rovněž popsán vliv rekonstrukce na perfúzní parametry. Celkově práce ukazuje, že díky komprimovanému snímání je možné zvýšit buď časové rozlišení při ponechání prostorového rozlišení, nebo při ponechání časového rozlišení lze zvýšit prostorové rozlišení.
|
|
|
Modelování v perfusním MR zobrazování
Válková, Hana ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Kratochvíla, Jiří (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá perfuzní analýzou pomocí magnetické rezonance DCE-MRI. Práce v úvodu popisuje problematiku akvizice dat pro DCE-MRI, nutnost použití kontrastních látek a přibližuje základní principy perfuzní analýzy. Dynamické chování kontrastní látky během distribuce v cévním řečišti lze popsat arteriální vstupní funkcí (AIF). Podoba křivek co nejblíže oblasti zájmu je ovlivněna tzv. disperzními jevy (VTF) vlivem distribuce kontrastní látky k oblasti zájmu. V konečném důsledku je systémové chování tkáně popsáno reziduální funkcí tkáně (TRF). V praktické části diplomové práce byly realizovány modely křivek AIF, VTF a TRF. Dále byl vytvořen simulační program pro snadnou práci s modely, jenž umožňuje provádět odhady perfuzních parametrů na základě neslepé dekonvoluce. Metoda byla ověřena na syntetických datech a ilustrována na klinických datech pacienta s karcinomem ledvin.
|
|
|
Komprimované snímání v perfuzním zobrazování pomocí magnetické rezonance
Mangová, Marie ; Veselý, Vítězslav (oponent) ; Rajmic, Pavel (vedoucí práce)
Perfúzní zobrazování pomocí magnetické rezonance je lékařská diagnostická metoda, která se zdá být v dnešní době velmi slibnou. Tato práce se zabývá řídkými reprezentacemi, rekonstrukcí matic s nízkou hodností a komprimovaným snímáním, které umožňuje překonání současných fyzikálních možností perfúzního zobrazování pomocí magnetické rezonance. Dále představuje několik modelů pro rekonstrukci naměřených perfúzních dat a uvádí numerické metody pro jejich softwarovou implementaci, která je důležitou součástí práce. Navržené modely jsou ověřeny na simulovaných i reálných perfúzních datech z magnetické rezonance.
|
|
|
Analýza Arterial Spin Labeling MRI dat
Galanová, Zuzana ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Krátká, Lucie (vedoucí práce)
Táto bakalárska práca sa zameriava najmä na perfúzne zobrazovanie metódou arterial spin labeling. Opisuje základné fyzikálne princípy magnetickej rezonancie, rekonštrukciu obrazu z nazbieraných dát, bezkontrastné perfúzne zobrazovanie, princíp a rozdelenie arterial spin labeling techník, kde sa venuje primárne sekvencii FAIR, ktorá patrí medzi techniky impulzného arterial spin labeling. Jedna z častí práce je venovaná tvorbe perfúznej mapy v Matlabe. Výsledky sú vyhodnotené na základe porovnania dát s Matlabu s dátami z programu Paravision Version 5.1. a sú zdiskutované.
|
|
|
Segmentace ultrazvukových sekvencí
Schwarzerová, Jana ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá základním popisem ultrasonografie, principem kontrastního zobrazení a aplikací segmentačních metod v ultrasonografické problematice. Z uvedených segmentačních metod byly některé metody vybrány a implementovány v programu Matlab verze R2015b. Algoritmy byly testovány na uměle vytvořených datech, na ultrazvukových fantómech i na reálných ultrazvukových obrázcích. Následně byla práce rozšířena na segmentaci ultrazvukových sekvencí.
|
|
|
Simulace farmakokinetických modelů
Hejč, Jakub ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Teoretická část projektu se zabývá rozborem farmakokinetických dějů a základními vlastnostmi matematických modelů užívaných ve farmakokinetice. Tento popis je zaměřen především na modely využívané pro perfúzní zobrazovací metody. Cílem projektu je vytvořit algoritmus pro simulaci vybraných modelů na základě zadaných parametrů a algoritmus sloužící k proložení experimentálně měřených dat vybraným modelem s výpočtem základních farmakokinetických parametrů. Dalším krokem řešení je realizace grafického rozhraní, které umožní plně využívat vytvořené algoritmy v uživatelsky přístupnějším prostředí. Výstupem práce je program, který lze využít k získání parametrů reálných dat a jako názorná ukázka vlivu těchto parametrů na průběh zvolených funkcí.
|
|
|
Kontrastní MRI perfuzní zobrazování
Šejnoha, Radim ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Krátká, Lucie (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce je zaměřena na kontrastní MRI perfuzní zobrazování pomocí metody Dynamic Contrast-Enhanced MRI. Jsou zde popsány základní principy nukleární magnetické rezonance a pulzní sekvence používané při DCE MRI. Práce obsahuje část věnovanou dynamickému kontrastnímu zobrazování fantomu na experimentálním NMR přístroji umístěném na Ústavu přístrojové techniky AV ČR v Brně. Výsledky měření jsou vyhodnoceny na základě modelů a získané perfuzní parametry jsou diskutovány.
|
|
|
Využití evolučních algoritmů pro lícování obrazu
Kubalová, Eva ; Kozumplík, Jiří (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Táto práca sa zaoberá využitím evolučných algoritmov pre lícovanie obrazových dát ako novšie používanou metaheuristickou optimalizačnou metódou. Obsahuje teoretický popis lícovania obrazov, s neskorším zameraním na ultrazvukové obrazy. Teoretickú časť dopĺňa kapitola zaoberajúca sa vybranými evolučnými algoritmami. Realizované boli tri optimalizačné metódy a to genetický algoritmus, metóda roja častíc a svetluškový algoritmus. Z pohľadu optimalizácie kriteriálnej funkcie boli vybrané kritériá suma štvorcov rozdielov, kosínové kritérium a korelačný koefcient. Hlavnou časťou práce je testovanie navrhnutých algoritmov s cieľom ich optimálneho nastavenia pre následnú registráciu reálnych ultrazvukových sekvencií získaných pomocou kontrastného zobrazenia. Záver práce sa venuje vyhodnoteniu dosiahnutých úspešností registrácie.
|
|
|
Uživatelské rozhraní pro rekonstrukci dat z magnetické rezonance
Marcin, Michal ; Rajmic, Pavel (oponent) ; Mangová, Marie (vedoucí práce)
Cieľom bakalárskej práce bolo vytvoriť grafické užívateľské rozhranie pre spracovanie dát magnetickej rezonancie pomocou kompresného snímania. Pre tento účel bolo použité vývojové prostredie Matlab. V prvej časti je popísaný základný princíp magnetickej rezonancie, spôsob snímania a grafického zobrazovania, ako aj jej matematické princípy kompresného snímania. V práci je popísaná metóda kompresného snímania a zobrazenia reálnych snímok s využitím laboratórnych myší. V druhej časti práce je popísané grafické užívateľské prostredie a jeho funkcie. Program dokáže simulovať a zobraziť model perfúzného zobrazovania na základe zadaných parametrov. Vytvorená aplikácia umožňuje rekonštrukciu a spracovanie simulovaných, ako aj reálnych dát. Všetky tieto údaje je možné následne uložiť do súboru a znova načítať.
|
|
| |
host ::
RSS.